En MicrozoneX encontré una guía para hacer backup a Utorrent.

Cita:

Activas utorrent.exe y lo configuras completamente. Luego cierras utorrent.
Luego mediante WinRAR o el explorador de Windows vas a la siguiente carpeta:
C:\Documents and Settings\usuario_SUYO\Datos de programa\uTorrent

Todos los archivos que están en –>
C:\Documents and Settings\usuario_SUYO\Datos de programa\uTorrent … los pasas a la carpeta uTorrent que está en la partición secundaria o los guardas para backup

Por cierto, sigo recomendando Utorrent 1.6.1, el mejor cliente de torrents, lejos.

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